HACCP它虽然不是一个零风险体系，却是一个食品安全控制的体系，它不是一个独立存在的体系。HACCP必须建立在食品安全项目的基础上才能使它运行。例如：良好操作规范（GMP）、标准的操作规范（SOP）、卫生标准操作规范（SSOP），由于HACCP建立在许多操作规范上，于是形成了一个比较完整的质量保证体系，HACCP作为最有效的食源疾患的控制体系已被国家或社会所接受。
现代意义上的食品安全起源是从HACCP开始的，HACCP是Hazard Analysis and Critical Control Point 的缩写，ISO22000认证办理，即“危害分析和关键控制点”，是对可能发生在食品加工过程中的食品安全危害进行识别、评估，ISO22000认证标准，进而采取控制的一种预防性食品安全控制方法。
通过分析HACCP与ISO9000质量管理体系两者的差异主要如下：
1、关注点不同
ISO9001:2008标准是一个管理体系标准，ISO22000认证咨询，它通过建立方针和目标并实现这些目标来达到对质量的指挥和控制，ISO22000认证，他关注的是使 与质量目标有关的实现结果适当地满足相关方的需求、期望和要求。而HACCP所关注的不是总体方针目标的制定和实现，而是通过进行危害分析、确定关键控制点、制定纠偏措施，以防止食品安全危害。这是两个不同层次的系统，其建立的思路、使用范围和评价要求均不同。
2、对控制的范围要求不同
ISO9001:2008与HACCP都要求对过程进行分析和识别和控制，但ISO9001:2008是要求企业对全部的质量体系过程进行识别，它包括质量管理体系、管理职责、资源管理、产品实现及测量、分析和改进五个大的要素，其中既控制过程质量，又控制产品质量，最终达到顾客满意。而HACCP只要求企业对影响安全卫生的危害进行分析，对确定的关键控制点进行控，通过７个方面的控制，达到预防、消除或降低危害。
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